https://chrov.is

ゲノム医療のためのトータルソリューションソフトウェア

Chrovisはゲノム医療をシステム面でサポートします。Chrovisでは、最先端のバイオインフォマティクスと膨大な文献情報をもとにした知識データベースを用いて、個人に合わせたレポート作成を支援します。

Chrovisでは、次世代シークエンシング(NGS)によって読み取った個人のゲノム情報を、すべて自動的に解析します。さらに、解析結果に、知識データベースを照らし合わせて意味付けし、パーソナライズされたレポーティングを行います。

具体的には、個人間や正常・腫瘍細胞間にわずかに存在するゲノムの変異を自動的に解析し、それらに遺伝子・たんぱく質などの変異の解釈を加えた後に、知識データベースによるアノテーションを行います。 知識データベースは、PubMedに保存されている数千万件の医学・生物学の文献を自然言語処理を用いて自動的に解析し、変異と薬剤との関係、薬剤と疾患との関係などの情報を体系化しています。 この知識データベースと個人のゲノムの変異の情報を照らしあわせ、患者個人に最適化されたレポートを作成します。
ゲノムは、生物を構成するタンパク質の生成・制御などの遺伝情報の集まりです。生命の設計図と良く例えられます。

ゲノム配列を読み取るシークエンシング技術が発展し、現在、ヒト1人の全ゲノム配列を約10万円・約1日で読み取ることが出来るようになっています。 2020年には、1万円・1時間で読み取る予測もあります。

このシークエンシング技術の発展に伴い、ゲノムに関連する医科学研究は急速に進歩しています。 今日、ゲノムを網羅的に検査し、効率的かつ効果的に病気の発見、診断、治療を行うゲノム医療の実装が期待されています。

ゲノム医療によって、かつてないほど正確な診断と患者に適合した治療が可能となります。 がん、希少疾患、感染症、認知症など、ゲノム医療が適用できる領域は広く、1日も早いゲノム医療の社会実装が望まれています。
ゲノム医療を実践するために必要な5つの工程 「1. 病理医による検査」「2. シークエンシング」「3. データ処理」「4. 意味付けとレポート」「5. エキスパートパネルによる協議」のうち、 Chrovisは「3. データ処理」と「4. 意味付けとレポート」を支援します。

Chrovisでは、開発したソフトウェアの一部をオープンソースソフトウェアとしてコミュニティに公開しています。https://github.com/chrovis

ニュース

  • 2018年7月8日 京都大学で開催されたクリニカルバイオバンク学会シンポジウム、セッション7「医療におけるバイオインフォマティクス AIの活用をどう進めるべきか」にて、テンクー代表の西村が「がんゲノム医療に向けたインフォマティクス:解析・知識データベース・レポート」と題して登壇いたしました。
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  • 2018年6月20日 日本病理学会研究推進委員会 次世代病理技術講習会(北海道大学)にて、テンクーが協賛をさせていただいたとともに、講習のひと項目として、代表の西村が「がんゲノム知識データベースの利用法」の講師を務めました。
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  • 2018年5月25日 第395回CBI学会講演会「第二回 ゲノム医療 ―臨床応用と全ゲノム解析への前哨―」(東京工業大学)にて、「がんゲノム医療に向けた情報解析と知識データベース」と題して、テンクーの西村が講演いたしました。
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  • 2018年5月12日 政策科学技術大学院大学にて開催された第195回知的財産マネジメント研究会 (Smips) 全体セッションにて、テンクー代表の西村が「データサイエンスとゲノム医療」と題してお話をさせて頂きました。
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  • 2018年4月24日 東北大学 東北メディカル・メガバンク機構 第1回ゲノム医療情報学研究会にて、「がんゲノム医療に向けた情報解析の取り組み」と題して、テンクーの西村がセミナーでお話をさせて頂きました。
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  • 2018年3月29日 羊土社実験医学 2018年4月号に「挑戦する人 情報の可視化を武器にゲノム医療の普及に挑む!【西村邦裕】」として、テンクー代表の西村のインタビュー記事が掲載されました。
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  • 2018年2月26日 日本経済新聞朝刊9面に、ゲノム医療研究についての記事で、テンクーの名前を掲載していただきました。GA4GHという、国際的なゲノムのデータシェアリングなどのための組織にテンクーも加入しており、AMED、東北メディカル・メガバンク機構とともに名前を入れていただきました。
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  • 2017年11月12日 朝日新聞出版 AERA2017年11月13日号 および webコンテンツ AERAdot.「東大「ご近所さん会」がはぐくむ 起業の“生態系”」の記事において、東京大学出身者による本郷周辺の技術系ベンチャー企業としてテンクーが紹介され、代表の西村のコメントが掲載されました。
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  • 2017年10月25日 日経メディカル 特別編集版 2017 AUTUMNに、テンクー代表の西村のコメントが掲載されました。
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  • 2017年10月10日 プログラミング言語ClojureのトップカンファレンスClojure/conj 2017にて、弊社の竹内俊貴が「Sequence and Concurrent Processing for Huge Genomic Data」と題して、バイオインフォマティクス領域におけるClojure利用について発表を行います。
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  • 2017年6月21日 日本経済新聞 2017年6月21日夕刊 ぱーそん「ゲノム医療 科学者が支える」の記事において、弊社の坂田理美が写真入りで紹介されたとともに、東京大学のがん関連の遺伝子変異と症状などの独自の「知識データベース」を作るプロジェクトにテンクーが参加している旨が掲載されました。
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  • 2017年5月22日 astavisionに「ゲノム情報を医療に役立てるには、意思決定をサポートするインタフェースが大事なんです」というタイトルで、代表の西村邦裕のインタビューが掲載されました。
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  • 2017年2月9日 このほど、東京大学の「ゲノム医療研究プロジェクト」が始動いたしました。テンクーは知識データベースの構築と情報解析に協力いたします。
  • プレスリリース
  • 2016年10月24日 WebDAVへの高速アップロードをサポートしたカメラアプリケーションUpupuのバージョン3を公開しました。
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  • 2016年10月18日 代表の西村のコメントが、韓国の新聞の東亜日報に掲載されました。
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  • 2016年9月7日 NHKクローズアップ現代にて、東京大学のある本郷周辺のベンチャー企業として、テンクーが紹介されました。
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  • 2016年8月19日 Chrovisのソフトウェアモジュールの1つであるゲノムのデータ解析ツールcljamが論文誌"Source Code for Biology and Medicine"に掲載されました。
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  • 2016年4月28日 中小企業基盤整備機構が運営しているJ-Net21に、代表の西村のインタビューが掲載されました。
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